Trostruki svjetski prvak Formule 1 u vozačkoj konkurenciji, Ayrton Senna, počeo je njegovati svoj odnos s Hondom 1987. godine. Japanska marka zamijenila je Renault u isporuci 1,5-litrenog V-6 motora s turbopunjačem za Team Lotus, a Senna je vješto iskoristio oko 1000 KS te je sezonu završio s dvije pobjede i 3. mjestom u ukupnom poretku. To je utrlo put Brazilcu da 1988. potpiše za McLaren, koji je također dobio Hondin motor. Pobijedio je drugog vozača u timu Alaina Prosta i te sezone osvojio prvi naslov prvaka u vozačkoj konkurenciji za volanom apsolutno dominantnog MP4-4. U međuvremenu, izvan F1 paddocka, Senna je odigrao ozbiljnu ulogu u evoluciji Hondinog New Sportscar Experimentala. S njim je tvrtka nastojala konkurirati Ferrariju i Porscheu, stvaranjem sportskog automobila koji se može voziti u svakodnevnom prometu. Tijekom testiranja prototipa, Senna je procijenio da je šasija malo krhka. Njegove precizne povratne informacije potaknule su Hondu da učvrsti okvir za 50 posto i poboljša ovjes.
Početkom 1991. iza Senne su već dvije F1 krune i spremao se krenuti u kampanju koja će donijeti i treću. Kao mali znak zahvalnosti, prema dogovoru između Honda Motor Companyja i vozača, proizvođač se obvezao osigurati tri NSX-a za osobnu upotrebu. Uz dva crna automobila, treći automobil je šasija s brojem T000233. Konfiguriran u Formula Red boji s kontrastnim crnim krovom, uvezla ga je Honda Automobil de Portugal i registrirala 22. ožujka 1991. pod brojem SX-25-59. NSX je bio uskladišten u Lisabonu i dostavljan Senni svaki put kad bi stigao u zemlju. Senna je očito dobro iskoristio automobil tijekom europske etape sezone 1991. godine, ikona F1 kupila je nekretninu u odmaralištu Quinta do Lago. Putovao je na Veliku nagradu Portugala u Estorilu, utrku za koju se kvalificirao kao treći i završio kao drugi, u šasiji T000233, a automobil se pojavio u dokumentarcu iz 1992. Ayrton Senna: Utrke su mi u krvi.
Deset mjeseci nakon što je Senna poginuo u Imoli, prema priloženoj potvrdi o evidenciji koju je izdao Lisabonski ured za registraciju automobila, automobil je registriran u portugalskoj prijestolnici u veljači 1995., a registrirala ga je Laboa Etablissement. Hondin faks kojim se potvrđuje Sennino vlasništvo ovog automobila dodatno navodi da je o NSX-u brinuo lokalni zastupnik Nipomotor u rujnu 1997. godine. Zatim ga je u studenom 2009. kupio MSCAR Comércio de Automóveis SA, sa sjedištem u gradu Faru u Algarveu, prije nego što ga je 2013. kupio gospodin Robert McFagan. Automobil je prevezen u Veliku Britaniju, gdje je registriran za upotrebu na cesti u svibnju 2016. godine.
NSX je posjetio Imolu 2019. godine, obilježavajući 25. godišnjicu Sennine kobne nesreće na talijanskoj stazi, s osnivačem tima Minardi F1 i šefom staze Giancarlom Minardijem za volanom. Automobil se potom vratio u domovinu, nakon što ga je 2024. godine kupio vlasnik u Nagoyi u Japanu, ali se opet vratio u Veliku Britaniju kako bi ga RM Sotheby’s ponudio na prodaju na londonskoj aukciji. Dakle, budući vlasnik dobit će kultni automobil za čijim je upravljačem sjedila ikona F1, po mnogima najbolji vozač svih vremena. RM Sotheby’s procjenjuje da će NSX dosegnuti vrijednost od 560 do 900 tisuća eura. Mnogi će reći: nije ni puno za automobil čiji je upravljač držao legendarni Ayrton.
